Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC4Q8TDY8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGDCC4Q8TDY8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGDCC4Q8TDY8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGDCC4Q8TDY8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGDCC4Q8TDY8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGDCC4Q8TDY8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IGDCC4Q8TDY8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IGDCC4Q8TDY8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGDCC4Q8TDY8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IGDCC4Q8TDY8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms