Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms