Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GNPDA2Q8TDQ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GNPDA2Q8TDQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GNPDA2Q8TDQ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms