Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK9Q8TD19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK9Q8TD19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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