Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATL2Q8NHH9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms