Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNL1Q8NG31 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms