Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL3Q8ND23 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL3Q8ND23 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL3Q8ND23 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms