Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG8Q8ND04 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG8Q8ND04 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms