Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDPRQ8NCN5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDPRQ8NCN5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms