Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMF1Q8NBK3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SUMF1Q8NBK3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF1Q8NBK3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms