Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GATD1Q8NB37 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATD1Q8NB37 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms