Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNDC5Q8NAU1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC5Q8NAU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms