Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MFSD2AQ8NA29 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms