Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX3Q8N9I9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms