Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN19Q8N6F1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN19Q8N6F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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