Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C17orf53Q8N3J3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf53Q8N3J3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms