Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms