Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNTD2Q8IXW0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNTD2Q8IXW0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMNTD2Q8IXW0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms