Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA4Q8IV77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms