Protein–RNA interactions for Protein: Q86YQ8

CPNE8, Copine-8, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE8Q86YQ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE8Q86YQ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPNE8Q86YQ8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE8Q86YQ8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms