Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DZIP3Q86Y13 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DZIP3Q86Y13 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DZIP3Q86Y13 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DZIP3Q86Y13 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DZIP3Q86Y13 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DZIP3Q86Y13 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DZIP3Q86Y13 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
DZIP3Q86Y13 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DZIP3Q86Y13 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DZIP3Q86Y13 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DZIP3Q86Y13 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms