Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNEQ86WN2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms