Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA24Q86W54 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms