Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCA5Q86VQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCA5Q86VQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCA5Q86VQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms