Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LHFPL3Q86UP9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHFPL3Q86UP9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHFPL3Q86UP9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms