Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF5Q86SE9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms