Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NPM2Q86SE8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM2Q86SE8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NPM2Q86SE8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms