Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMC1Q7Z7K0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMC1Q7Z7K0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms