Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLNKQ7Z7G1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLNKQ7Z7G1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms