Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC6Q7Z403 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms