Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
KRT27Q7Z3Y8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT27Q7Z3Y8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
KRT27Q7Z3Y8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT27Q7Z3Y8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms