Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP54Q7Z3B4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP54Q7Z3B4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms