Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCXQ7RTU7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCXQ7RTU7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms