Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX8Q7RTT4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX8Q7RTT4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX8Q7RTT4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms