Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms