Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTOP2Q7RTS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP2Q7RTS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms