Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SV2AQ7L0J3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SV2AQ7L0J3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms