Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP43Q70EL4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP43Q70EL4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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