Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYDE1Q6ZW31 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms