Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RFX8Q6ZV50 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX8Q6ZV50 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX8Q6ZV50 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms