Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND5BQ6ZUT9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND5BQ6ZUT9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms