Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTU2

EP400NL, EP400 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400NLQ6ZTU2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EP400NLQ6ZTU2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EP400NLQ6ZTU2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400NLQ6ZTU2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms