Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZRN4Q6ZMN7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDZRN4Q6ZMN7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.2 ms