Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANBP10Q6VN20 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RANBP10Q6VN20 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP10Q6VN20 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms