Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCBE1Q6UXH8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCBE1Q6UXH8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms