Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A10Q6U841 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A10Q6U841 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A10Q6U841 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms