Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCD3Q6STE5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMARCD3Q6STE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMARCD3Q6STE5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms