Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZBED9Q6R2W3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZBED9Q6R2W3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZBED9Q6R2W3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms