Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFXN4Q6P4A7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms