Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF40BQ6NWY9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF40BQ6NWY9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms