Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RWDD4Q6NW29 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RWDD4Q6NW29 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms